Une analyse faite par des chercheurs de l’Université de Copenhague portant sur les os et des dents de 130 individus qui moururent de maladies contagieuses aux alentours de 37.000 ans bp a révélé qu’ils contractèrent ces maladies par le contact avec les animaux domestiques qu’ils élevèrent après avoir abandonné le statut de chasseurs-cueilleurs. L’élevage eut un profond impact sur la santé humaine, qu’il a conservé au long des millénaires.
L’étude a porté sur la présence de microbes dans les restes humains retrouvé dans divers pays le monde entier et à différentes époques. Les chercheurs utilisèrent le fait que l’analyse des génomes de plusieurs catégories de population s’est généralisée récemment à partir des restes retrouvés dans les sépultures de diverses époques. De même ont été analysés les génomes des bactéries et des virus conservés avec les dents et les ossements de ces populations. I300 génomes de restes humains furent aussi analysé au cours de ce travail. Ceci en fait l’étude la plus ambitieuse conduite à ce jour.
Les génomes des microbes de la peste, Yersinia pestis, y compris ceux de la peste noire, ont été retrouvés dans 3 % des cadavres, ce qui est relativement peu. Vient ensuite le microbe dit Borrelia Recurentis infectant les poux du corps, responsable de fièvre récurrentes très fréquentes dans le passé et presque disparues aujourd’hui.
Le séquencement de l’ADN ne s’applique pas aux virus à ARN tels que celui de la grippe et les divers coronavirus. Ceux-ci ont donc échappé à l’étude.
Référence
The landscape of ancient human pathogens in Eurasia from the Stone Age to historical times
doi: https://doi.org/10.1101/2023.10.06.561165
Summary
Infectious diseases have had devastating impacts on human populations throughout history. Still, the origins and past dynamics of human pathogens remain poorly understood1. To create the first spatiotemporal map of diverse ancient human microorganisms and parasites, we screened shotgun sequencing data from 1,313 ancient human remains covering 35,000 years of Eurasian history for ancient DNA deriving from bacteria, viruses, and parasites. We demonstrate the widespread presence of ancient microbial DNA in human remains, identifying over 2,400 individual species hits in 896 samples. We report a wide range of pathogens detected for the first time in ancient human remains, including the food-borne pathogens Yersinia enterocolitica and Shigella spp., the animal-borne Leptospira interrogans, and the malaria-causing parasite Plasmodium vivax. Our findings extend the spatiotemporal range of previously described ancient pathogens such as Yersinia pestis, the causative agent of plague, Hepatitis B virus, and Borrelia recurrentis, the cause of louse-borne relapsing fever (LBRF). For LRBF we increase the known distribution from a single medieval genome to 31 cases across Eurasia covering 5,000 years. Grouping the ancient microbial species according to their type of transmission (zoonotic, anthroponotic, sapronotic, opportunistic, and other), we find that most categories are identified throughout the entire sample period, while zoonotic pathogens, which are transmitted from living animals to humans or which have made a host jump into humans from animals in the timeframe of this study, are only detected from ∼6,500 years ago. The incidence of zoonotic pathogens increased in our samples some 1,000 years later before reaching the highest detection rates ∼5,000 years ago, and was associated with a human genetic ancestry component characteristic of pastoralist populations from the Eurasian Steppe. Our results provide the first direct evidence for an epidemiological transition to an increased burden of zoonotic infectious diseases following the domestication of animals2. However, they also reveal that the spread of these pathogens first becomes frequent thousands of years after increased animal-human contact, likely coinciding with the pastoralist migrations from the Eurasian Steppe3,4. This study provides the first spatiotemporal map of past human pathogens using genomic paleoepidemiology, and the first direct evidence for an epidemiological transition of increased zoonotic infectious disease burden after the onset of agriculture, through historical times.
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