Des chercheurs ont crée une variété de levure (yeast) dans laquelle la moitié des 16 chromosomes sont synthétiques (artificiels). Ceci est considéré comme un grand pas en avant vers la réalisation d’une cellule complexe dotée d’un génome entièrement synthétique. En anticipant fortement il est possible de penser que la réalisation d’un être vivant complexe entièrement synthétique n’est qu’une question de temps…et pourquoi pas un humain ?
Dans l’immédiat Joef Bocke de New York University Langone Health estime que cette réalisation constituera une excellente plateforme pour fabriquer des produits utiles à l ‘humanité. Son équipe a déjà réalisé des virus et des bactéries avec des génomes entièrement artificiels, mais dans le cas des levures qui sont des êtres vivants bien plus complexes, il s’agit d’une première.
Aujourd’hui, le premier objectif est de déboguer, c’est-à-dire enlever les défauts de fabrication, des génomes artificiels, afin d’obtenir des êtres aussi efficaces que leurs correspondants vivants. Ensuite, il faudra ajouter plus de 3.000 sites au génome artificiel de la levure, pour obtenir des produits plus performants que ne l’est la levure naturelle.
Il conviendra que de telles recherches soient conduites dans les laboratoires sécurisés, afin que ces produits n’échappent pas prématurément et ne contaminent pas toute la nature, ce qui avait été le cas concernant le Covid 19.
Référence
Debugging and consolidating multiple synthetic chromosomes reveals combinatorial genetic interactions
Summary
The Sc2.0 project is building a eukaryotic synthetic genome from scratch. A major milestone has been achieved with all individual Sc2.0 chromosomes assembled. Here, we describe the consolidation of multiple synthetic chromosomes using advanced endoreduplication intercrossing with tRNA expression cassettes to generate a strain with 6.5 synthetic chromosomes. The 3D chromosome organization and transcript isoform profiles were evaluated using Hi-C and long-read direct RNA sequencing. We developed CRISPR Directed Biallelic URA3-assisted Genome Scan, or “CRISPR D-BUGS,” to map phenotypic variants caused by specific designer modifications, known as “bugs.” We first fine-mapped a bug in synthetic chromosome II (synII) and then discovered a combinatorial interaction associated with synIII and synX, revealing an unexpected genetic interaction that links transcriptional regulation, inositol metabolism, and tRNASerCGA abundance. Finally, to expedite consolidation, we employed chromosome substitution to incorporate the largest chromosome (synIV), thereby consolidating >50% of the Sc2.0 genome in one strain.
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